R-скрипты, которые запускаются только последовательно, есть ли способ распараллелить их выполнение на многоядерные?

У меня есть несколько R-сценариев, которые могут выполняться только последовательным образом, не могут быть разбиты на куски или любая параллельная библиотека для R или любой другой язык не может быть использован.

Можно ли как-то распределить последовательное выполнение кода на несколько ядер или на несколько серверов в сети? ускорить исполнение?

1 ответ

Итак, давайте предположим, что вы можете запустить:

./my_script.R arg1

И вы хотите запустить скрипт на arg1..arg1000, Тогда вы можете использовать GNU Parallel:

parallel ./my_script.R {} ::: arg1 arg2 arg3 .. arg1000

Это начнется один my_script.R на поток процессора.

Если у вас есть несколько серверов в вашем распоряжении, вы можете ssh чтобы:

parallel -Sserver1 -Sserver2 ./my_script.R {} ::: arg1 arg2 arg3 .. arg1000

Если это не отвечает на ваш вопрос, пожалуйста, уточните вашу ситуацию.

Другие вопросы по тегам