Разрешение / владелец проблема с нажатием Git при редактировании непосредственно из репо?

У меня есть веб-интерфейс для развертывания скриптов из нашего репозитория в Github на нашем работающем сервере. Веб-интерфейс просто запускает скрипт bash с некоторыми командами git. Если я делаю изменения локально, нажимаю на репо, а затем запускаю скрипт bash, чтобы вытащить репо, чтобы жить, он работает нормально. Однако, если я внесу изменения непосредственно в репо (через веб-интерфейс Github), у меня возникнут проблемы с перемоткой вперед / блокировкой.

Вот шаги, которые я предпринимаю:

1. Внесите изменения в файл в репозитории Github

2. Запустите bash-скрипт (как apache) через Интернет с живого сервера, который пытается выполнить git push / pull. Получите эти проблемы:

   PUSH
   To git@github.com:name/name.git
   ! [rejected]        master -> master (non-fast-forward)
   error: failed to push some refs to 'git@github.com:name/name.git'
   To prevent you from losing history, non-fast-forward updates were rejected
   Merge the remote changes before pushing again.  See the 'Note about
   fast-forwards' section of 'git push --help' for details.
   
   PULL
   From github.com:name/name
   branch            master     -> FETCH_HEAD
   error: unable to unlink old 'includes/footer.inc' (Permission denied)
   Updating 8f6d922..d1eba9d
   Updating 8f6d922..d1eba9d
   

3. SSH в качестве root, попробуйте push / pull, и все работает нормально.

Идеи о том, почему этот метод не работает из Apache?