Как найти источник работающей системы с медленными часами?

У меня проблема на одном из моих серверов Gentoo. Через некоторое время часы начинают работать очень-очень медленно. Это займет около одной минуты на одну секунду, чтобы уйти. Основная проблема заключается в том, что это влияет не только на часы, но и на медленную работу системы. Если я бегу topтребуется более 10 секунд, чтобы открыть. sleep 1 занимает около минуты.

В системе нет нагрузки, почти ничего не работает. Я использую ядро ​​4.0.5. Аппаратные часы работают нормально.

Что может быть источником такой проблемы?

Вот информация о часах:

# cat /sys/devices/system/clocksource/clocksource0/available_clocksource
refined-jiffies jiffies tsc
# cat /sys/devices/system/clocksource/clocksource0/current_clocksource
refined-jiffies