Проблема конфигурации MySQL Socket в my.cnf

У меня есть проблема, которая приводит к очень долгому "времени в базе данных" в моем приложении.

БД Percona MySQL 5.5.35.

Приложение работает отлично, и может читать / писать из базы данных просто отлично. Проблема в том, что у меня необычайно большое время отклика БД, которое определенно не тратится на выполнение запросов, которые просты и кэшированы.

Например, я случайно получу время отклика в несколько секунд, а в других случаях это займет всего несколько миллисекунд. Существует медленная настройка журналов запросов, и никакие запросы не являются медленными, все они представляют собой простые вставки крошечных данных и около 80% операций чтения, вся БД занимает всего 20 МБ, это интернет-форум.

Я уверен, что проблема заключается в сокете, так как я не могу указать сокет, указанный в разделе mysqld my.cnf. Если я это сделаю, я получаю ошибку при перезапуске базы данных, говоря:

ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/var/lib/mysql/mysql.sock' (2)

Так, например, вот действующая рабочая копия my.cnf с удаленными несущественными частями:

[mysql]

# CLIENT #
port                           = 3306
socket                         = /var/lib/mysql/mysql.sock


[mysqld]

# General #
default-storage-engine         = InnoDB

# Database replication #
server-id=1895149
log-bin=mysql-bin
log-error=mysql-bin.err
binlog_do_db=reefbase1

# MyISAM #
key-buffer-size                = 32M
myisam-recover                 = FORCE,BACKUP

Заметьте, что порт и сокет не указаны в разделе mysqld?

Если я изменю это на:

[mysql]

# CLIENT #
port                           = 3306
socket                         = /var/lib/mysql/mysql.sock


[mysqld]

port                           = 3306
socket                         = /var/lib/mysql/mysql.sock

# General #
default-storage-engine         = InnoDB

# Database replication #
server-id=1895149
log-bin=mysql-bin
log-error=mysql-bin.err
binlog_do_db=reefbase1

# MyISAM #
key-buffer-size                = 32M
myisam-recover                 = FORCE,BACKUP

Вот как я вижу снова и снова, my.cnf должен быть настроен, мой сервер не запускается с ошибкой "невозможно подключиться".

Любой совет будет очень признателен.